《细胞分裂6》的游戏场景非常开放，关卡呈现出多元化的设计思路，抵达任务点的路径并不固定，玩家需要自己在反复的游戏过程中总结出最佳的路线。这为那些喜爱潜行的玩家提供了极大的帮助，除了随处可见的阴影和障碍物之外，天花板中也隐蔽着很多通风管道可供玩家使用。
游戏中有经验的玩家完全可以非常文艺的不杀害一个敌人而达成自己的任务，此时被判定为“幽灵”，而对普通玩家来说，任务过程中发生有限交火是很正常的事，此时玩家会获得“猎豹”的评定，但如果你是一名真汉子的话，那么就去挑战“袭击”的称号吧，这种情况下《细胞分裂6》将会更加偏向于一款动作游戏。虽然三种玩法的风格迥异，但都设立有不同的成就和奖杯，建议玩家都能够逐一体验，这样会获得不少额外的乐趣。
总的说来，《细胞分裂6》还是比较强调潜行元素的，与《杀手5》非常相似的一点是两者都会对完美的暗杀活动给予奖励，比如当玩家从背后杀死一个敌人并将尸体藏匿在垃圾箱中时，系统就会提供一些额外的报酬，而这些报酬可以被用来强化主角的武器道具，而在危急情况下玩家对于多种道具的灵活配合使用也增添了乐趣和成就感。